Die Einzel (englisch: single) Photonen-Emissions-Computer-Tomographie (SPECT) ist mit der PET insofern vergleichbar, als auch sie mit radioaktiv markierten Stoffen die Hirndurchblutung und den Hirnstoffwechsel messen kann. Sie ist technisch weniger aufwändig und wird von vielen Kliniken und niedergelassenen Ärzten angeboten. Allerdings ist die SPECT im Gegensatz zur PET wesentlich ungenauer.